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在内蒙古自治区党委、政府，以及内蒙古大学的支持下，“内蒙古大学高分子化学及蒙药研究所”于1999年底正式挂牌成立。2003年底，该研究所由自治区科技厅确定为“内蒙古自治区蒙药化学重点实验室”（以下将高分子所和重点实验室统称为：高分子所）。
为开展创新药研究和蒙药研发工作，促进内蒙古大学和全区科技创新和人才培养工作，用自治区政府拨给的建立研究所的专项经费500万元，在内蒙古大学提供的实验室和学科条件，建设成了较现代化的高分子化学和蒙药研究的科研基地和人才培养中心：内蒙古大学高分子化学及蒙药研究所，既内蒙古自治区蒙药化学重点实验室。
